Năm nay, kỳ thi THPT Quốc gia vẫn được tổ chức với 8 môn thi như năm trước là: Toán, Ngữ văn, Lịch sử, Địa lí, Vật lí, Hóa học, Sinh học, Ngoại ngữ. Các môn Toán, Ngữ văn, Lịch sử, Địa lí thi theo hình thức tự luận; các môn Vật lí, Hóa học, Sinh học thi trắc nghiệm; môn Ngoại ngữ thi viết và trắc nghiệm.


Trong số 29 thí sinh được miễn thi có 13 thí sinh Trường THPT chuyên Phan Bội Châu có 13 thí sinh là thành viên của đội tuyển quốc gia tham dự vào kỳ thi tuyển chọn vào đội tuyển Olympic Quốc tế có các em (Phan Duy Phúc, Võ Hải Thiện, Nguyễn Minh Tiến, Ngô Thị Trà, Nguyễn Hà Trang, Nguyễn Anh Tú, Bùi Lâm Dương, Lê Nguyễn Thùy Dương, Nguyễn Đình Quang, Cao Trọng Duy Nhân, Ngô Sỹ Dũng, Mai Tùng Dương, Lê Anh Đức). Trong số 7 học sinh thuộc diện được miễn thi môn Ngoại ngữ trong xét cộng nhận tốt nghiệp THPT năm 2016, Trường THPT chuyên Phan Bội Châu có 6 em và Trường chuyên Đại học Vinh có 1 em.

Kỳ thi THPT Quốc gia Nghệ An được tổ chức theo 2 cụm thi: Cụm thi cho thí sinh dự thi để lấy kết quả xét công nhận tốt nghiệp THPT và xét tuyển sinh đại học, cao đẳng, do Trường Đại học Vinh chủ trì và cụm thi cho thí sinh dự thi để lấy kết quả xét công nhận tốt nghiệp THPT do Sở Giáo dục và Đào tạo chủ trì.